Σύμφωνα με τον ν.3937/2011 (ΦΕΚ 60/Α/31-3-2011) Αρθ. 5, ως σημαντικά στοιχεία φυσικού περιβάλλοντος (οικοτόπων και ειδών) είναι οι περιοχές Natura, τα Καταφύγια Άγριας Ζωής (ΚΑΖ), τα Εθνικά Πάρκα, οι Εθνικοί Δρυμοί κ.λπ.
Εντός των ορίων του Δήμου Καρπενησίου εντοπίζονται τα εξής σημαντικά στοιχεία και προστατευόμενες περιοχές φυσικού περιβάλλοντος:
Δίκτυο προστατευόμενων περιοχών Natura 2000:
1. Όρος Τυμφρηστός (Βελούχι) (GR2430001 - SCI A
2. Όρος Παναιτωλικό (GR2310004 - SCI A)
3. Φορείς Διαχείρισης: Φορέας Διαχείρισης Εθνικού Δρυμού Οίτης, Κοιλάδας Σπερχειού και Μαλιακού Κόλπου, Φορέας Διαχείρισης Λιμνοθάλασσας Μεσολογγίου – Ακαρνανικών Ορέων
Καταφύγια Άγριας Ζωής:
1. Κ284 Μάρτσα-Κοκκινόβρυση (Κλειστού) (ΦΕΚ 708/Β/80)
2. Κ300 Βούζια-Καπνοράχη (Φουρνών-Χοχλιά) (ΦΕΚ 1512/Β/76)
3. Κ312 Ρόβια-Καραβάκι-Ροβόλακκα (Καρπενησίου) (ΦΕΚ 39/Β/76)
4. Κ307 Βελούχι-Αγ. Τριάδας (ΦΕΚ 923/Β/76)
5. Κ295 Αν. Κλιτύς-Όρος Τυμφρηστού (Πιτσιωτών-Νεοχωρίου-Μαυρίλου-Μερκάδας (ΦΕΚ 834/256-76)
6. Κ322 Κοκκάλια-Κερασιά-Πετράλωνα-Αγκάθι (Σταυροπηγίου-Κρικέλλου) (ΦΕΚ 698/Β/21-9-82)
7. Κ327 Τουρνέσι-Σταυρός (Σταυροπηγίου-Κρικέλλου-Στάβλων) (ΦΕΚ 393/23-3-76)
8. Κ814 Δημοτικά Διαμερίσματα Κορυσχάδων και Βουτύρων Δήμου Καρπενησίου (ΦΕΚ 352/Β/1703-00), Κ332 Προυσός (ΦΕΚ 707/Β/86)
Ο Δήμος Καρπενησίου δε διαθέτει Εθνικά Πάρκα, Εθνικούς Δρυμούς και Αισθητικά Δάση