Σύμφωνα με τον ν.3937/2011 (ΦΕΚ 60/Α/31-3-2011) Αρθ. 5, ως σημαντικά στοιχεία φυσικού περιβάλλοντος (οικοτόπων και ειδών) είναι οι περιοχές Natura, τα Καταφύγια Άγριας Ζωής (ΚΑΖ), τα Εθνικά Πάρκα, οι Εθνικοί Δρυμοί κ.λπ.
Στον Δήμου Ζακύνθου εντοπίζονται τα εξής σημαντικά στοιχεία φυσικού περιβάλλοντος:
Το Εθνικό Θαλάσσιο Πάρκο Ζακύνθου με ΦΕΚ θεσμοθέτησης 906/Δ/1999 και Φορέα Διαχείρισης Εθνικού Θαλάσσιου Πάρκου Ζακύνθου. Στα όρια του βρίσκονται οι σημαντικότερες παραλίες ωοτοκίας της θαλάσσιας χελώνας Caretta caretta και σκοπό ίδρυσης του Ε.Θ.Π.Ζ. τη διαφύλαξη της σημαντικότατης φυσικής κληρονομιάς και η διατήρηση της οικολογικής ισορροπίας της θαλάσσιας και παράκτιας έκτασης, καθώς των νησίδων του κόλπου του Λαγανά και των νησίδων Στροφάδων, της ΠΕ Ζακύνθου, με παράλληλη ανάπτυξη δραστηριοτήτων που εναρμονίζονται με την προστασία της φύσης και του τοπίου στην ευρύτερη περιοχή τους.
Δίκτυο προστατευόμενων περιοχών Natura 2000, με Φορέα Διαχείρισης Εθνικού Θαλάσσιου Πάρκου Ζακύνθου
o GR2210001 - SCISPA ΔΥΤΙΚΕΣ ΚΑΙ ΒΟΡΕΙΟΑΝΑΤΟΛΙΚΕΣ ΑΚΤΕΣ ΖΑΚΥΝΘΟΥ, 21464.92εκτ.
o GR2210002 - SCI A ΚΟΛΠΟΣ ΛΑΓΑΝΑ ΖΑΚΥΝΘΟΥ (ΑΚΡ. ΓΕΡΑΚΙ-ΚΕΡΙ) ΚΑΙ ΝΗΣΙΔΕΣ ΜΑΡΑΘΩΝΗΣΙ & ΠΕΛΟΥΖΟ, 6977.66 εκτ.
Καταφύγια Άγριας Ζωής:
Στην περιοχή μελέτης υπάρχει ένα Καταφύγιο Αγρίας Ζωής (ΚΑΖ) με κωδικό K425, ΦΕΚ 575/Β/79 και ονομασία Βραχιώνας (Γυρίου - Μαριών).
Μικροί Νησιωτικοί Υγρότοποι (ΦΕΚ 229/ΑΑΠ/2012):
o Y221ZAK004, Εκβολή ρυάκια Κατασταρίου, 6.00 εκτ.
o Y221ZAK007, Y221ZAK007, 33.00 εκτ.
Όσον αφορά το φυσικό περιβάλλον, στην περιοχή μελέτης είχαν ξεσπάσει τα τελευταία χρόνια (από το 2016) πυρκαγιές μη αμελητέου μεγέθους. Το 2016 στην θέση Κοιλιωμένος, ξέσπασε πυρκαγιά έκτασης 178.19 εκταρίων. Το 2017 ξέσπασαν πυρκαγιές σε πολλές θέσεις του νησιού. Στον Βασιλικό (Ντερέτες) ξέσπασε πυρκαγιά 47,78 εκταρίων, στο Όρος Σκοπός 71,28 εκταρίων, στον Αγαλά 816,71 εκτάρια, στο Λαγωπόδο 43,59 εκτάρια, στη θέση Κοιλιωμένος ξάνά 108,88 εκτάρια, στο όρος Βραχίονα 279.84 εκτάρια, στις Ορθονιές 234,88 εκ., στην θέση Αναφωνήτρια 1387,90 εκτ. και τέλος στις Άνω Βολίμες 127.07εκτ. Το έτος 2018 εξελίχθηκαν αρκετές πυρκαγιές σε πολλά και διάσπαρτα σημεία του νησιού. Παρόλα αυτά οι εκτάσεις ήταν οι λιγότερες της τελευταίας 5ετίας. Συγκεκριμένα στην θέση Βροντόνερο Καλαμακίου κάηκαν 9,19 εκτάρια γης, στη θέση Αργάσι , 5,61εκτ, στη θέση Καταλούπου, 22,41 εκτ., στη θέση Κοιλιωμένος 10,23 εκτάρια και τέλος Υπεράγαθος Κοιλιωμένου 11,51 εκτάρια γης.
Το 2019 στην θέση Λιθακιά ξέσπασε πυρκαγιά η οποία άφησε πίσω της 148.89 εκτάρια καμένης γης. Το έτος 2020 ξέσπασαν πυρκαγιές στην θέση Βολίμες (179.21εκτ.), Μαριές – Έξω Χώρα (78.00εκτ.), Λούχα (6,27 εκτ.) και τέλος Λαγκαδάκια (23.76εκτ.). Το τρέχον έτος από τα νότια στα βόρεια ξέσπασαν πυρκαγιές στην θέση Λαγκαδάκια (7,82εκτ.), Όρος Σκοπός (1.27εκτ.), Νερατζούλες (4.33εκτ.), Αργάσι (6,88εκτ) και τέλος Ρομίρι έλτασης 13.88 εκταρίων.