Σύμφωνα με τον ν.3937/2011 (ΦΕΚ 60/Α/31-3-2011) Αρθ. 5, ως σημαντικά στοιχεία φυσικού περιβάλλοντος (οικοτόπων και ειδών) είναι οι περιοχές Natura, τα Καταφύγια Άγριας Ζωής (ΚΑΖ), τα Εθνικά Πάρκα, οι Εθνικοί Δρυμοί κ.λπ.
Εντός των ορίων των Δ.Ε. Σπερχειάδος, Αγίου Γεωργίου Τυμφρηστού, Μακρακώμης, Τυμφρηστού του Δήμου Μακρακώμης εντοπίζονται τα εξής σημαντικά στοιχεία και προστατευόμενες περιοχές φυσικού περιβάλλοντος:
Δίκτυο προστατευόμενων περιοχών Natura 2000:
● Όρος Τυμφρηστός (Βελούχι) (GR2430001 - SCI A), Κοιλάδα & εκβολές Σπερχειού- Μαλιακός Κόλπος (GR2440002 - SCI A)
● Κάτω Ρους και εκβολές Σπερχειού Ποταμού (GR2440005 – SPA)
● Όρος Βαρδούσια (GR2450008 – SPA). Φορείς Διαχείρισης: Φορέας Διαχείρισης Εθνικού Δρυμού Οίτης, Κοιλάδας Σπερχειού και Μαλιακού Κόλπου, Φορέας Διαχείρισης Εθνικού Δρυμού Παρνασσού.
Καταφύγια Άγριας Ζωής:
• Κ295 Αν. Κλιτύς-Όρος Τυμφρηστού (Πιτσιωτών- Νεοχωρίου- Μαυρίλου- Μερκάδας) (ΦΕΚ 834/25-6-76),
• Κ319 Άγ. Θεόδωρος-Γαύρος (Γαρδικίου-Λευκάδος-Καμπίων) (ΦΕΚ 256/2-5-88)
• Κ319 Άγ. Θεόδωρος-Γαύρος (Γαρδικίου-Λευκάδος-Καμπίων) (ΦΕΚ 256/2-5-88)
• Κ314 Γουλινά (Παλαιοβράχας-Καλλιθέας-Σπερχειάδας) (ΦΕΚ 747/12-12-85)
Ο Δήμος Μακρακώμης δε διαθέτει Εθνικά Πάρκα, Εθνικούς Δρυμούς και Αισθητικά Δάση